מהנעשה בשיאון
יואל זרון - שיאון
yoel@sion-israel.com
הג'נומיק נמצא בזינוק
סיכום כנס האינטרבול
ריגה, לטוויה, יוני 0102
טיפוח הבקר נמצא בעיצומה של מהפכה גדולה - מהפכת הג'נומיק שבה נגיע לקיצור אורך הדור ללא מבחן פרים מקובל עם בנות. מדינות רבות עוסקות בנושא, הרבה אינטרסים מסחריים ובתוך כל זה מנסה ארגון האינטרבול לגבש קורת גג מקצועית אחידה לכל מדינות העולם. ד"ר יואל זרון, המנהל המקצועי של שיאון חזר לאחרונה נפעם מכנס האינטרבול בריגה
האינטרבול, מקבל החלטות בקצב אחר מהתקדמות התוצאות הנתמכות בעיקרן ע"י גופים מסחריים (אגודות ההזרעה) וגופים ממשלתיים או אוניברסיטאיים. את מערך הנתונים הוא מקבל בצורה סדירה ובהתאם לקורלציות הגנטיות בין המדינות וה-MACE (Multiple-trait Across (Country Evaluationמקבלות המדינות את נתוני הפרים. ה-MACE הינו דוגמה חיובית לפיתוח משותף של החוקרים והאינטרבול. למעשה, בחירת הפרים להזרעה בין המדינות מתבססת על ה- .MACEבמצגות ובדיונים הועלו דרכי הפעולה לשילוב הג'נומיק המתבסס על מערך ה-.GEBV, GMACE להלן תמצית של מספר קבוצות שהציגו את עבודותיהם בכנס. פרוט רב יותר נמצא ב"סיכום כנס האינטרבול - יוני 0102, ריגה" בשיאון. גודל קיט הסריקה: שלושים הכרומוזומים בבקר יכולים להיסרק ע"י ה- SNPsבגדלים שונים: .3K, 20K, 50K, 100Kההבדלים בתוצאות הם: בדיוק, במהימנות, בכמות המידע, בערכים כספיים ובמטרות הסריקה. VanRadenנתן סקירה מלאה על שיטה חדשה הנקראת Imputation ("שיוך") שבעזרתה אפשר יהיה לחזות תוצאות של סריקה יקרה ומהימנה יותר ( )50Kבעזרת הסריקה של .3Kהקבוצה מחפשת דרכים כלכליות ויעילות יותר למימוש הג'נומיק בבקר. הרעיון המרכזי הוא חיפוש האללים בקיטים המכילים 3Kשל ( SNPsזולים יותר, מהירים יותר לתפעול) ודרכם למצוא את ההפלואידים הרצויים (מספר אללים הנמצאים על כרומוזום) הנמצאים בכרומוזומים השונים. שלב ראשון: סריקה בסמנים רבים בפרטים רבים באוכלוסייה. זיהוי וסימון ההפלואידים בכרומוזומים (למעשה, סימון התכונות בגנום) . שלב שני: חיפוש ההפלואידים ע"י מציאת אללים בודדים בקיטים קטנים של . SNPsבבסיס השיטה המשפט הבא: "( Read genotypes, write haplotypeקרא ג'נוטייפ ותכתוב הפלואיד") נס האינטרבול היה ביחד עם כנס ה- ICARוהשתתפו בו כ-071 אנשים. בכנס ה- ICARהיו כ-053 אנשים מכ-54 מדינות. עיקר הנושאים באינטרבול התעמקו בג'נומיק ובניתוח תכונות הנמצאות באינדקסי הטיפוח השונים בעולם. לאחר המהפכה שחוללה ההזרעה המלאכותית ויכולת שימור תאי הזרע, בסוף שנות ה-04, מגיע הג'נומיק ויוצר את המהפכה השנייה - קיצור אורך הדור, הפעלת פרים צעירים ללא בנות, במהימנות של כ-%07 ואף יותר, החלפה מהירה יותר של קבוצות הפרים ודיוק רב יותר בבחירתם מקבוצת מקור איכותית. הקצב מסחרר והמערכות עדיין לא מעכלות את היכולות של האפשרויות השונות להפעלה.
כ
פרות בתחרות מלכת היופי בבאר טוביה
35